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精选同行评议的期刊出版物

• Tegtmeier R, Pompili V, Singh J, Micheletti D, Silva JK, Malnoy M, Khan MA。2020.候选基因定位确定了火疫病易感基因的基因组变异HIPM和DIPM在整个马吕斯种质。科学报告，10,16317。
• Papp D, Gao L, Thapa R, Olmstead D, Khan MA。2020.田间苹果赤霉病的易感性具有多样性马吕斯种质资源收集为苹果育种确定了潜在的抗性来源。CABI农业和生物科学，在新闻。
• Thapa R, Zhang K, Snavely N, belong gie S, Khan MA。2020.植物病理学2020挑战数据集分类苹果叶面病害。应用生态学报，8 (9)，e11390。
• J . Singh, c . Cobb-Smith, D . Higgins, E . Khan MA。2020.横向流动免疫分析法、LAMP和定量PCR对苹果园火疫病诊断的比较评价。植物病理学杂志，https://doi.org/10.1007/s42161-020-00644-w。
• Yu M, Singh J, Khan MA, Sundin GW, Zhao Y. 2020。火疫病病原的全基因组序列欧文氏菌amylovora应变Ea1189。植物-微生物分子相互作用，https://doi.org/10.1094/MPMI-06-20-0158-A。
• Pereira G, Gemenet D, Mollinari M, Olukolu B, Wood J, Diaz F, Mosquera V, Gruneberg W, Khan MA, Buell R, Yencho C, Zeng ZB。2020.同源多倍体的多QTL定位:随机效应模型方法在甘薯全同胞群体中的应用。遗传学，215(3)，579-595。
• 杨宏文，俞敏，刘杰，马可汗，赵宇。2020。参与(p)ppGpp前体生物合成的基因特征欧文氏菌amylovora。植物病理学杂志，https://doi.org/10.1007/s42161-020-00583-6。
• Papp D, Singh J, Gadoury D, Khan MA。2020.北美新分离的秦冠能克服苹果结痂的抗性吗马吕斯多花植物821.植物病害，104(3)，649-655。
• 引用本文:Singh J, Fabrizio J, Desnoues E, Pereira Silva J, Busch W, Khan MA。2020.根系性状对苹果早期火疫病易感性的影响(马吕斯×有明显)。植物生理学通讯，19(1)，1-14。
• M, Olukolu B, Pereira G, Khan MA, Gemenet D, Yencho C, Zeng ZB。2019.利用超密多位点图谱分析甘薯六倍体遗传。3(1):基因|基因组|基因
• 辛格和马可汗。2019.不同的自然选择模式决定了火疫病病原的亚种群结构，欧文氏菌amylovora。科学报道，9(1)，1-13。
• Gemenet D,佩雷拉G, Boeck D,木头J, Mollinari M, Olukolu B, F·迪亚兹,Mosquera V, Ssali R,大卫·M Kitavi M,布尔戈斯G, Zum Felde T, Ghislain M,凯里E, Swanckaert J,硬币L,范Z,汉密尔顿J,雅达B, Yencho C,曾庆红ZB,旺达R,汗马,Gruneberg W过活R . 2019。定量性状位点和差异基因表达分析揭示了六倍体甘薯β-胡萝卜素和淀粉含量负相关的遗传基础[番薯甘薯(l)Lam。]。理论与应用遗传学，133,23 -36。
• 李霞，张敏，张敏，马可汗，张生，吴杰。2019。梨200K SNP基因分型芯片的研制及其在遗传定位、基因组组装改进和GWAS中的应用(Pyrus)。植物生物技术学报，17(8)，1582-1594。
• Pereira Silva KJ, Singh J, Bednarek R, Fei Z, Khan MA。2019.两个苹果品种对火疫病的不同基因调控反应(马吕斯×有明显)。园艺研究，6(1)，35。
• Singh J, Pereira Silva KJ, Fuchs M，和Khan MA。2019.气候、土壤和植物微生物群落在苹果树快速退化中的潜在作用PloSONE, 14 (3)， https://doi.org/10.1371/journal.pone.0213293。
• 吴,刘KH、曹问汉密尔顿JP,太阳H,周C, Eserman L, Gemenet特区Olukolu英航,王H, Crisovan E, Godden G,焦C,王X, Kitavi N, Manrique-Carpintero N,瓦兰蔻B, Wiegert-Rininger K,杨X,保K, Schaff J, Kreuze J, Gruneberg W,汗马,Ghislain M, D,江J,旺达R, Leebens-Mack J,硬币L, Yencho C,范过活R, z . 2018。对栽培甘薯的两个二倍体野生亲缘体进行了基因组序列分析，揭示了遗传改良的目标。自然通讯，9(1)，4580。
• Lau KH, del Rosario Herrera M, Crisovan E, Wu S, Fei Z, Khan MA, Buell CR, Gemenet DC。2018.甘薯在脱水胁迫下的转录组学分析确定了耐旱性候选基因。Plant Direct, 2 (10)， https://doi.org/10.1002/pld3.92。
• Zhou C, Duarte T, Silvestre R, Rossel G, Mwanga RO, Khan MA, George AW, Fei Z, Yencho GC, Ellis D, Coin LJ。2018.从叶绿体基因组的杂交组装对东非甘薯品种群体结构的认识。盖茨开放研究，5(2)。
• Villordon A, Gregorie JC, LaBonte D, Khan MA, Selvaraj M. 2018。低磷和夯实层处理对“河口Belle”和“Beauregard”甘薯根长变化的响应园艺科学，53(10)，1534-1540。
• 吴军，王勇，徐军，Korban SS, Fei Z, Tao S, Ming R, Tai S, Khan MA, Postman JD, Gu C. 2018。亚洲和欧洲梨的多样化和独立驯化。基因组生物学，19(1)，77。
• Desnoues E, Norelli JL, Aldwinckle HS, Wisniewski ME, Evans KM, Malnoy M, Khan MA。2018.苹果抗火疫病新品系特异性、环境依赖小分子qtl的鉴定。植物分子生物学报道，36(2)，247-256。
• 白娟，毛娟，杨辉，马可汗，范安，刘生，张杰，王栋，高慧，张杰。2017。蔗糖非发酵相关蛋白激酶2 (SnRK2)基因可以介导马铃薯的应激反应(茄属植物tuberosuml .)。BMC遗传学，18(1)，41。
• Ramírez DA, Yactayo W, Rens LR, Rolando JL, Palacios S, De Mendiburu F, Mares V, Barreda C, Loayza H, Monneveux P, Zotarelli L, Khan MA, Quiroz R. 2016。定义与植物水分状况相关的生物阈值以监测水分限制效应:马铃薯的关键指标是气孔导度和光合恢复。农业水资源管理，177,369-378。
• Saravia D, Farfán E, Gutiérrez R, Mendiburu F, Schafleitner R, Bonierbale M, Khan MA。2016.马铃薯的产量和生理响应表现出不同的应对干旱胁迫和施氮策略。中国马铃薯学报，29(3)，431 - 434。
• Lindqvist Kreuze H, Khan MA, Salas E, Meiyalaghan S, Thomson S, Gomez R, Bonierbale M. 2015。安第斯马铃薯二倍体家族的块茎形状和眼深变化。BMC遗传学，16(1)，57。
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• Potts SM, Khan MA, Han Y, Kushad MM, Korban SS. 2014。苹果果实品质性状的数量性状位点(qtl)鉴定。植物分子生物学报道，32(1)，109-116。
• 马可汗，赵玉凤，Korban SS. 2013。植物抗火疫病相关基因座的鉴定马吕斯通过QTL和关联映射的结合使用。植物生理学报，34(3)，351 - 356。
• 施王吴J, Z, Z,张年代,明R, Z石林,汗马,道年代,Korban党卫军,王H,陈NJ西T,徐X, Cong L气K,黄X, Y,赵X,吴J,邓C,郭台铭C,周W,阴H,秦G,沙Y, Y道,陈H,杨Y, Y,詹D,王J,李L,戴M,顾C,王Y, D,王X,张H,曾庆红L,郑D,王C,陈M,王G,谢,Sovero V, Sha S, Huang W, Zhang S, Zhang M, Sun J, Xu L, Li Y, Liu X, Li Q, Shen J, Wang J, paul RE, Bennetzen JL, Wang J, Zhang S. 2012。梨基因组(Pyrus bretschneideriRehd)。基因组研究，23(2)，396-408。
• 马可汗，韩燕，赵宇飞，Troggio M, Korban SS. 2012。一个多群体一致的遗传图谱揭示了不一致的标记顺序可能归因于苹果基因组的结构变化。PloSONE, 7 (11)， https://doi.org/10.1371/journal.pone.0047864。
• 陈军，马可汗，邱卫民，李军，周辉，张强，郭伟，朱婷，彭杰，孙飞，李晟，科尔班斯，韩勇。2012。单子叶和双子叶植物中编码颗粒结合淀粉合酶(GBSS)的基因的多样化是由多个全基因组重复事件标志的。PloSONE, 7 (1)， https://doi.org/10.1371/journal.pone.0030088。
• Khan MA, Han Y, Korban SS. 2012。基于GoldenGateTM平台的高通量苹果SNP基因分型分析。GENE (Elsevier)， 494, 196-201。
• Potts SM。， Han Y, Khan MA, Kushad MM, Rayburn AL and Korban SS. 2011。遗传多样性和特征的一个核心集合马吕斯利用简单序列重复(SSRs)的种质资源。植物分子生物学报道，30(4)，827-837。
• 韩艳，郑东，Vimolmangkang S, Khan MA, Beever JE, Korban SS. 2011。苹果物理和遗传图谱的整合证实了苹果基因组的全基因组和片段复制。实验植物学报，27(4)，531 - 534。
• Graham IA, Besser K, Blumer S, Branigan CA, Czechowski T, Elias L, Guterman I, Harvey D, Isaac PG, Khan MA, Larson TR, Li Y, Owens S, Pawson T, Penfield T, Rae AM, Rathbone DA, Ross J, Smallwood MF, Segura V, Townsend T, Vyas D, Winzer T and Bowles D. 2010。基因图谱青蒿L.鉴定影响抗疟药物青蒿素产量的多个位点，科学，327,328-331。
• Le Roux PM, Khan MA, Duffy B, Patocchi A, Broggini GAL和Gessler C. 2010。苹果品种‘Florina’和‘NovaEasygro’抗火疫病的数量性状定位。基因组,53岁,710 - 722。
• 马可汗，Durel C- e, Duffy B, Drouet D, Kellerhals M, Gessler C and Patocchi A. 2008。水稻火疫病抗性相关qtl的鉴定与验证马吕斯及其在标记辅助选择中的适用性。第12届真木树果实育种与遗传研讨会。园艺学报，814,753-758。
• 马可汗，杜瑞尔C- e，杜菲B，德鲁埃D，凯勒赫尔斯M，盖斯勒C和帕托基A. 2007。火疫病抗性“Fiesta”连锁群7个主要QTL分子标记的开发及其在标记辅助选择中的应用。基因组,50岁,568 - 577。
• MA Khan, Duffy B, Gessler C, Patocchi A. 2006。苹果抗火疫病的QTL定位。分子育种，17,299-306。

选定的评论文章和书籍章节

• Peil A, Emeriewen OF, Khan MA, kostik S, Malnoy M. 2020。我国抗火疫病育种现状马吕斯。植物病理学杂志，https://doi.org/10.1007/s42161-020-00581-8。
• Gemenet DC和Khan MA。2017.在无性繁殖作物中实施基因组选择的机遇和挑战。在“作物改良的基因组选择”中。编辑R. Varshney, M. Roorkiwal和M. Sorrells。
• Rasheed A, Hao Y, Xia X, Khan MA, Xu Y, Varshney RK, He Z. 2017。作物育种芯片和基因分型平台:进展、挑战和展望。分子植物，10(8)，1047-1064。
• MA Khan, Gemenet D, Villordon A. 2016。根系结构与非生物胁迫耐受性:块根和块茎作物的最新知识。《植物科学前沿》，71584年。
• Khan MA和Korban SS. 2012。森林树木和水果作物的关联映射。实验植物学报，63(11)，4045-4060。
• 马可汗，赵燕，科尔班，2011。病原菌的发病机制和耐药性的分子机制欧文氏菌amylovora，是蔷薇科火疫病的病原。植物分子生物学报道，30(2)，247-260。

扩展的出版物

• Khan MA和Papp D. 2020。证实了苹果抗病性的崩溃马吕斯多花植物821是北美抗痂病育种的最重要来源。《纽约水果季刊》，28(1)，5-7。
• 范·佐伦和马可汗。2020.利用计算机视觉检测苹果叶面病害。康奈尔合作推广，安大略湖水果计划。水果注意年代, 20(7)。
• MA Khan, Cobb-Smith D, Higgins L, Singh J。2019.苹果园火疫病管理病原菌检测方法研究。纽约水果季刊，27(2)，27-30。
• 马可汗和辛格。2019.苹果树迅速减少的潜在原因。纽约水果季刊，27(2)，15-18。
• Khan MA, Desnoues E和Clark M。2018.菌株对苹果火疫病反应的影响。纽约水果季刊，26(2)，15-20。
• 汗马。2018.菌株在品种对火疫病反应中的重要性。康奈尔合作推广，安大略湖水果计划。水果注意年代, 18(5)。
• 马可汗和辛格。2018.苹果品种对火疫病的反应机制各不相同。纽约水果季刊，26(4)。
• 马可汗，赵涛。2017。野生苹果品种对苹果园抗火疫病可持续生产具有重要意义。纽约水果区y， 25(4)， 13-18。
• Merk HL, Wheeler N, Sim S, Khan MA, Harry D, Kling J, Zhang Z, Van Deynze A, Francis D. 2012。关联分析。扩展基础。可以在:http://www.extension.org/pages/63011/association-analysis。
• 汗马。2012.关联映射和流苏软件教程。扩展基础。可以在:http://www.extension.org/pages/62755/association-mapping-and-tassel-software-tutorial。
• 汗马。2011.键不平衡(ld)衰变的估计。扩展基础。可以在:http://www.extension.org/pages/61909/estimation-of-linkage-disequilibrium-ld-decay。

选择邀请演讲

• 苹果病害管理的寄主抗性、易感水平和根系性状的遗传。学生邀请;密歇根州立大学PBGB-Corteva研究生研讨会;2019年12月。
• 用于检测和疾病管理的基因组和表型技术阿尔及利亚康斯坦丁生物技术研究中心;2019年9月。
• 降低寄主易感度和砧木性状是防治火疫病的两种有效策略宾夕法尼亚州立大学州立学院植物病理学与环境微生物学系;2019年9月。
• 多年生植物营养繁殖和木本作物的RSA对非生物和生物抗逆性的意义“植物根系:植物有益根际微生物相互作用的门户”;APS植物健康;俄亥俄州克利夫兰;2019年8月。
• 马吕斯品种:苹果抗虫抗病的宝贵遗传资源，国际火疫病研讨会;密歇根州特拉弗斯城;2019年6月。
• 菌株特异性对提高苹果抗火疫病能力和管理的重要性，第九届国际蔷薇科基因组学大会，南京，中国;2018年6月。
• 提高作物的抗逆性:基因组学，基因组学和环境伊利诺伊大学香槟分校;2017年9月。

• 格兰特将帮助研究人员在美国预防苹果火灾-康奈尔纪事报[2010-10-05]
• 苹果赤霉病研究的目标是抗病基因-好水果种植者[2010-02-20]
• 火疫病向北蔓延，威胁到苹果园-《纽约时报》[2019-12-02]
• 奖励基金在数字农业的创新-《康奈尔纪事报》[2019-06-14]
• 年轻的苹果树正在死去，没有人知道为什么-《经济学人》[2019-04-13]
• 某种东西正在迅速杀死北美果园里的年轻苹果树。科学家们难住了-科学- [2019-03-21]
• 8项拨款关注中国的创新-《康奈尔纪事报》[2019-03-27]