高密度连杆地图的构建和血管霉菌抗性的血管抗性抗性的QTL检测 - 衍生的'Norton'
普通英语的研究提供了康奈尔教师，学生和员工的日记文章的简要介绍，非技术摘要。
作者：Surya Sapkota，李凌陈，山山杨，凯蒂E.罗马，Lance Cadle-Davidson和Chin-Feng Hwang
理论和应用的遗传学，132（1），第137-147页。DOI：10.1007 / S00122-018-3203-6。2019年1月。
janet van zoeren摘要。
外带。
- 通过组合两种类型的遗传标记：单核苷酸多态性（SNP）和简单的序列重复（SSR）而开发了一种高分辨率血管型衍生品种“Norton”的高分辨率遗传图。
- 发现遗传基因座，源于诺顿衍生的葡萄型抗柔软霉菌的表型差异的34％。
- 此基因座源自“Norton”父母，之前是未被描述的。它现在被指定为“RPV27”。
背景。
由真菌oomycete引起的葡萄霜霉病（DM）是一种破坏性疾病vitis Vinifera葡萄生产区。许多北美物种vitis.对DM耐药，之前的研究发现，共有26个与DM抗性相关的遗传区域（见Divilov等人2018的成熟摘要）。借助与这些地区相关的DNA标记，葡萄育种者能够选择在幼苗阶段柔软的植物和更有效地培育新品种的植物。
使用“SSR”遗传映射确定了大多数先前的DM电阻区域，这可以与广泛在哪里找到某人的房子，而不是确切的街道或房屋号码来比较。那些“低分辨率”地图提供了关于育种者应该保留的幼苗的不精确信息。通过将先前的SSR映射技术与Vitisgen1产生的基于GBS的SNPS相结合，SAPKOTA等。在“诺顿型葡萄园”中，在“Norton'X'BabernetSauvignon”混合葡萄树中的高分辨率遗传联系地图“诺顿”X''Babernet Sauvignon'混合葡萄园中的杂交葡萄园用于搜索与“北派的葡萄园的抗DM相关的新遗传区域。
实验。
为了将遗传区域与各种表型联系起来，包括DM阻力，通过交叉'Norton'（V. Aestivis.，耐用'Cabernet Sauvignon'（V. Vinifera.， 易受影响的）。182年杂交F1后代被种植在密苏里州立大学的水果实验站，在山脉小树林，这些葡萄藤中的DNA加上两个父母，用于SSR和SNP分析。
每种杂种和父母的DM易感性都在现场和实验室中进行评估。在实验室中，叶子被DM孢子接种，然后在1-5的等级上进行视觉评分感染并进行显微镜。在该领域，目视评估通过本赛季进行三次，并在1-5的等级中进行得分。每个评估由两位研究人员独立进行，分数平均。
使用QTL（定量特性基因座）映射软件相结合了遗传映射和表型研究的结果，该软件确定DNA码中哪种差异与葡萄DM易感性的差异最强烈相关。
结果。
确定了超过四千名遗传标记。比较来自184个葡萄园的遗传信息，发现了4,236个地点，其中遗传信息一直存在，但个人之间存在不同。其中，映射了2,072个标记，发现分布在所有葡萄的染色体上。遗传标记代表区域，如果与诸如DM抗性的重要表型特征相关，则向饲养者提供信息，允许它们使用“标记辅助选择”（MAS），一种时间和资源有效的方法来培育改善的葡萄品种。
发现了一种用于DM抗性的遗传区域。将4,236个遗传标记与DM表型数据相结合，发现单个遗传区域始终与DM抗性相关。此区域以前未被描述，作者将其指定为RPV27.。
结论和实践考虑因素。
使用SNP和SSR标记策略在“Norton”X的Cabernet Sauvignon'映射人口上，作者能够找到与“诺顿”谱系中的DM电阻相关的先前未认出的基因座。这次发现将为葡萄饲养员提供另一种工具，他正在寻找在新葡萄品种中包括DM抗性的方法，特别是它们看起来包括多种电阻基因来赋予耐受性的耐用性。
janet van zoeren是一个延伸支持专家，位于园艺，基于日内瓦的康奈尔·阿特里克（Corneld Agritech）纽约。