Melanie Filiatrault是位于纽约州伊萨卡市的美国农业部(usda)新兴害虫和病原体研究联合中心的一名分子生物学家。访问梅勒妮的美国农业部-美国航天局的资料。
我的研究的主要目的是破译基因调控的分子机制,特别是涉及病毒相关的基因,在重要的模式生物两了解细菌是如何在全球范围内对环境信号作出反应的。在我们的研究小组中,我们正在使用几种方法(转录组学、蛋白质组学和代谢组学)来评估紫丁香的全球基因调控。该研究项目的一个目的是开发高通量的方法,将精确识别转录起始位点,并将基因分配到转录单位。这些努力将有助于基因组注释,为分类为“假设”的基因的转录活性提供实验证据,也可能识别来自基因间区域的转录本。此外,这些基因组规模的策略将描绘启动子序列,启动子类别,并确定那些共同调控的基因。这些研究将有助于为更完整的转录组分析提供关键信息p .两这最终将有助于理解这种细菌的发病机理。
此外,我们正在研究小的非编码RNA和RNA结合蛋白在基因调控中的作用p .两。小rna已被证明在细菌对各种环境信号的应激反应中发挥重要的调控作用,如温度、渗透压、铁和氧化应激的变化。它们也是许多调控途径的重要组成部分,并已被证明在毒性重要因素的调控中具有关键作用。到目前为止,只有少数的小RNA和RNA结合蛋白在文献中被描述p .两。利用多种全球方法,包括生物计算方法、分子生物学和高通量测序的结合,我们正在识别和表征小的非编码rnap .两。这些研究将有助于理解基因的全局调控p .两并为其他假单胞菌和植物病原体提供数据。