斯坎隆实验室的研究重点是植物形态发育和进化的机制。利用比较发育遗传学和功能基因组学，我们对分生组织形成叶子和胚胎的过程特别感兴趣。本实验室利用玉米、拟南芥、番茄、卷柏和藓类小立杯藓的叶片和胚胎突变体作为比较研究这些植物发育基本过程的基础。
选定的日记出版物
谷歌学者个人资料和出版物。
- Li, X., Leiboff, S., Li, X., Hu, H., Todt, N., Yang, J., Li, X., Yu, X., Muehlbauer, G. J., Timmermans, M. C., Yu, J., Schnable, P. S., & Scanlon, M. J. (2015).玉米茎尖分生组织形态多样性的遗传控制。自然通信。
- Frank，M. H.，＆Scanlon，M. J.（2015）。苔藓小立碗藓芽三维发育的细胞特异性转录组学分析。植物杂志。83：743-751。
- Frank, M. H.， Edwards, M. B.， Schultz, E. R.， Fei, Z.， Sorensen, I.， Rose, J. K.， & Scanlon, M. J.(2015)。从两个古老植物谱系中解剖到顶端细胞型芽分子的分子鉴定。新的植物学家。207：893-904。
- Johnston, R.， Leiboff, S.， & Scanlon, M. J.(2014)。玉米(Zea mays)叶鞘基部的个体发育。新植物学家。205:306 - 315。
- Johnston，R.，Wang，M.，Sun，Q.，Sylvester，A.W.，Hake，S.，＆Scanlon，M. J.（2014）。转录组分析表明，玉米韧带发育概括了横向器官引发期间发生的基因表达模式。植物细胞。12月16日PII：TPC.114.132688。[epub领先]。
- Frank，M. H.，H.，Scanlon，M. J.（2014）。通过协调选择血管色素和孢子素遗传计划的孢子体 - 优势土壤植物中射击分发功能演变的转录组据证据。MBE：分子生物学和进化。
- Zhang, X.， Dougal, R. N.， Strabel, J.， Lee, M.， Buckner, B.， Janick-Buckner, D.， Schnable, P. S.， Timmermans, M. C.， & Scanlon, M. J.(2012)。斑点维管表达1是一种新的叶片模式基因，在玉米ta-siARF通路下游发挥作用。植物生理学。159：1453-1462。
- Takacs, E, Nettelton, D.， Schnable, P. S.， Muehlbauer, G. J.， Yu, J.， Timmermans, M. C.， & Scanlon, M. J.(2012)。玉米茎顶分生组织的个体发育。植物细胞。24：3219-3234。
- Woodward, J. B.， Abeydeera, N. D.， Paul, D.， Phillips, K.， Rapala-Kozik, M.， Freeling, M.， Begley, T. P.， Ealick, S. E.， McSteen, P.， & Scanlon, M. J.(2010)。玉米硫胺素营养丰盈在拍摄公司维护方面有缺陷。植物细胞。22：3305-3317。
- Ji, J.， Strable, J.， Shimizu, R.， Koenig, D.， Sinha, N.， & Scanlon, M. J.(2010)。WOX4促进了Procambial Development。植物生理学。152：1346-1356。
外展和延伸重点
Scanlon是关于一项新拨款的新授权，将培训杜鲁门州立大学（苏）的本科生，该议院，莫克斯维尔农村克尔克斯维尔的公共文艺制度，将进行玉米发育突变体的形态，表达和转录组分析。Co-Pi Timmermans的实验室将在第1年夏季举办8周的TSU本科，以在两种玉米发育突变体和非突变兄弟姐妹上进行LM-RNA喃咯。Co-Pi的Janick-Buckner和Buckner将花费一周前往Timmermans的实验室参加数据收集，并体验CSHL的许多丰富机会。Co-PI Buckner将参加1年内基因组数据的CSHL车间统计分析，以促进RNASEQ数据的处理和分析，并在这些技术中指示楚本生成。楚本科将每年在玉米遗传会议以及地方和区域会议上展示他们的数据。这些活动将在植物基因组学中将TSU Co-PI和本科生揭示到最先进的调查。Co-Pi欧文斯（康奈尔）将导致夏季Reu学生（1-3），他将研究玉米线的光合生理学，玉米线在阴影避免的形态方面表现出极端。此外，欧文斯工厂生理实验室课程中的本科生将参与使用体内叶绿素荧光监测的光合变化的筛选。
Scanlon是关于一个NSF授予的PI，提供了一个由合作司机领导的多媒体公共教育倡议来创建“杂草”的资金。David Micklos of Dolan Dna学习中心（DDLC）在寒春港实验室。“杂草奇迹”将展示玉米研究的连续性 - 从玉米生殖器，玉米遗传学家，植物生理学家和分子生物学家 - 在玉米基因组测序项目中有息息。与对玉米植物的演变的这种故事同时，“杂草想知道”也会讲述玉米对人类文化的影响。利用音频和视频格式的序列化播客，“杂草至奇迹”将提供对科学，技术和社会之间的互动的案例研究。多媒体内容将与DDLC开发的在线实验和生物信息学工具集成，并将与NSF资助的倡议IPLANT一起传播全国范围内。实际实验的连续性将允许中学，高中，并开始大学生从蛋白质遗传和生物信息分析到基因组结构和演化的检查，从核遗传和生物信息分析无缝进展。该项目处于第二年的发展年份，预计将于2011年初发布。
一种。目标。
Scanlon实验室的外联活动的目标是双重组合：（1）促进现代植物生物学的毕业生和本科教育和研究培训，（2）促进现代植物生物学中的公共教育。
b.成就/外联活动
与杜鲁门州立大学合作:
在过去的七年中，PI Scanlon领导了玉米SAM项目，这是一个NSF植物基因组研究项目，包含了一个旨在传播对植物科学的理解和欣赏的大学生动手训练和教育项目。在此期间，30多名来自密苏里州科克斯维尔郊区人文学院杜鲁门州立大学的本科生在微阵列数据的注释、SAM数据库的创建和维护方面发挥了关键作用，并接受了遗传学、组织学、并对本项目产生的玉米突变体进行分子分析。杜鲁门大学的本科生参加所有的项目会议，并在每年的国际玉米遗传学会议上展示他们的数据。这些学生中，有12人的手稿获得了作者身份，20多人毕业于中山大学并正在攻读研究生学位。
研究培训外联活动：
Scanlon在UGA和康奈尔的任期期间训练了十五本科生在分子遗传学中进行实验室工作。Scanlon在UGA教授了一个课程“基因技术”，六年来毕业，本科生。两个生物学本科生就是在获得本课程后在Scanlon的实验室中获得研究经验，并在Scanlon的实验室中工作。Scanlon成为地理博士学位博士的共同顾问。D学生注册了基因技术，并培训了他进行濒危植物物种的SSR分析。这名学生发表的两篇论文中的所有分子遗传（现在是佛罗里达大西洋U.的助理教授）在普朗斯在UGA的实验室进行了。PI Scanlon作为NSF外展活动的一部分，在萨科的雪松萧山高中AP生物学教室提出研讨会;大约60％的学生们参加雪松萧条高中代表了科学中代表的少数群体。一名高中高中招募并在斯卡隆实验室兼职工作。2006年夏天，PI Scanlon的实验室举办了博士博士·赫萨尼奥廖洛博士两周，他训练在QRT-PCR和激光 - 微放映微阵列技术。Hacisalihoglo博士是佛罗里达A＆M教授，该教授是佛罗里达州塔拉哈西的历史上黑人大学。 Also during summer 2006 and 2007, Scanlon hosted and trained High School student Eric Kelsey, who was recruited from Kennebunkport, ME High School by Cornell’s PGRP REU outreach program. Kelsey worked on a project to analyze evolution of the narrow sheath duplicated genes in the genus Zea. Cornell undergraduate Devon Van Noble, an African-American student interested in public health and environmental law, worked as a laboratory assistant in the Scanlon laboratory for two years. During summer 2007, undergraduate student Doug Eudy (Truman State U) spent 10 weeks in the Scanlon lab studying reverse genetics and in summer 2008 undergraduate student Samantha Wronski (SUNY Canton) worked as an REU student learning reverse genetics and plant developmental biology. During summer 2009, NSF REU student Eric Schultz of Northern Illinois University worked with graduate student Margaret Frank on histological analyses of shoot branching in Selaginella and targeted mutagenesis of WOX genes in Physcomitrella. Currently, Cornell undergraduate biology students Molly Edwards and Neiman Tan are being trained for research work in the Scanlon laboratory. Scanlon currently serves as Co-PI on grant for the Cornell REU program funded by NSF.
公共教育外展活动 - 杂草奇迹：
Another outreach component that is funded by Scanlon’s NSF-PGRP SAM grant is a collaboration for public education headed by Dr. David Micklos - director of the Dolan DNA Learning Center (DDLC) - a non-profit public resource for genetics education located at Cold Spring Harbor. Micklos has developed a multimedia internet site entitled "Weed to Wonder", that presents the continuity of research on corn - from native agriculturalists to agricultural breeders, corn geneticists, plant physiologists, and molecular biologists –that has culminated in the Maize Genome Sequencing Project. In parallel with this story of human impact on the evolution of the corn plant, "Weed to Wonder" also tells the story of corn’s impact on human culture. Utilizing serialized podcasts in audio and video formats, "Weed to Wonder" provides a case study of the interaction between science, technology, and society. Anticipating the release of the corn genome sequence in November, 2009, a videography team from the DNALC went to Mexico to document the story behind the research and put the genome sequence into the context of the history of maize cultivation. This is presented in the podcast “Explosive Origins of Corn”. In addition, the "Sequencing the Maize Genome" link includes animations describing step-by-step the different DNA-sequencing approaches used by the American and Mexican teams, a video tour of the Genome Sequencing Center at Washington University in St. Louis, and commentary on the project by researchers involved. Another production for the Weed to Wonder site is an historical recreation of CSHL in 1909, with George Shull explaining his experiment on hybrid vigor that is the foundation of all hybrid corn grown today. In addition to the Shull video recreation, Development of Hybrid Maize features an animation of Shull’s experiment with hybrid maize, three of his original research papers, and an image gallery. Barbara McClintock’s World , on the life of the Nobel Prize winner, includes images of the scientist as well as artifacts from her lab at CSHL, where she discovered transposons (so-called “jumping genes”). Two animations explain her work with transposons, and a downloadable PDF timeline of McClintock’s life and work is also available.
学生动手实验包括两个DNALC开发的在线实验笔记本。中学生读物《孟德尔遗传》通过对人类和玉米遗传性状的探索，介绍孟德尔定律。“在玉米中检测转座子”，以年纪较大的学生为目标，调查了玉米的青铜(bz)突变体，以分析基因型和表型之间的分子关系。
杂草崇拜2010年3月31日获颁51,475次访问，这比与CSHL研究人员（Greenomes，10,461次访问和动态基因）合作开发的类似网站。在来年，我们的合作者将在墨西哥拍摄的镜头射击历史上制定额外的故事，并预计其他摄像识旅行，以捕获玉米发展故事的其他元素作为主食和研究模式。
