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由布莱恩弗里德兰德
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鉴定细菌家族的传统科学过程——即血清分型——可能很耗时。对于沙门氏菌,过去需要3天,在某些情况下需要超过12天来确定复杂伺服器的最终分类。

康奈尔的研究人员,火星全球食品安全中心在北京,格鲁吉亚大学制定了一种完成全基因组测序的方法,以在八小时内仅为两小时内测定沙门氏菌血清型和整个识别过程。

他们的研究于2月24日在杂志中发表。

测定沙门氏菌的血清型使食品安全循环更容易找到细菌污染来源,这可能发生在各种食物中,例如水果,蔬菜,坚果,肉,谷物,婴儿配方和宠物食品。

“随着食品供应链变得更加全球和相互关联,食物污染沙门氏菌的机会增加,”领先作家硅唐,博士说。'15,中国Mars全球食品安全中心的微生物风险管理高级研究科学家。“在快速移动的食品制造世界中,在这种情况下快速鉴定和对沙门氏菌污染事件的反应至关重要,培养更有效的病原体鉴定方法至关重要。”

唐说,常规血清型一直处于公共卫生监测的公共卫生监测核心。但长期转变时间,高成本和复杂的样品准备工作导致全球食品安全监管机构,食品当局和公共卫生机构转变为病原体亚型的全基因组测序方法。

所有38个沙门氏菌菌株 - 代表34次血清型 - 使用全基因组测序精确预测本研究中的评估血清型水平。

这是食品行业的重要消息,因为很少有实验室可以进行古典血清型,说马丁维德曼1997年获博士学位,食品安全盖勒特家族教授康奈尔食品系统研究所教师。

“在一些国家,”Wiedmann说:“甚至需要暂时的沙门氏菌到经过认证的实验室可能需要两天时间。”

他说,随着全基因组测序,新的最先进的测试依赖于简单的设备。“对于食品行业来说,加工厂位于不知名的地方,”他说。“现在您可以在靠近食品加工厂的实验室中进行测试。”

据美国疾病控制与预防中心(U.S. Centers for Disease Control and Prevention)的年度估计,在美国,沙门氏菌每年导致约130万人感染,超过2.6万人住院治疗,400多人死亡。

不同的沙门氏菌血清型通常来自不同的地方,Wiedmann说,他通过一个例子解释了这个过程:鸡肉馅饼。

沙门氏菌是从哪里来的?”他说。“有胡萝卜、豌豆、鸡肉和香料。如果你有肠炎沙门氏菌——这通常与鸡肉有关——那么你要寻找和追踪鸡肉的来源。如果你有virchow沙门氏菌,这种血清型通常与东南亚的食物有关,那么你就会想要从那里找到香料。…血清分型为食品安全科学家提供了优先寻找的清单。”

除了硅胶和Wiedmann,其他研究人员还在研究中,“实时纳米孔测序技术在沙门氏菌血清型预测中的应用,“冯旭,崇涛葛,郝罗,广涛张,阿比盖尔·斯蒂瓦文森和罗伯特C.贝克·全球食品安全中心;格鲁吉亚大学李和襄武邓熹。MARS全球食品安全中心提供资金。

本文也出现在康奈尔纪事中。

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