斯坎隆实验室的研究重点是植物发育的机制和植物形态的进化。利用比较发育遗传学和功能基因组学，我们对分生组织形成叶子和胚胎形成分生组织的过程特别感兴趣。我们的实验室利用玉米、拟南芥、番茄、卷柏属和苔藓小立藤属的叶片和胚胎突变体作为对这些植物发育基本过程的比较研究的基础。
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谷歌学者简介和出版物。
- 李鑫，莱博夫，S.，李鑫，胡宏，托德，N.，杨，J.，李鑫，于鑫，米尔鲍尔，G. J.，蒂默曼斯，M. C.，于，J.， Schnable, P. S.， &斯坎隆，M. J.(2015)。玉米茎尖分生组织形态多样性的遗传控制。自然通讯。
- 弗兰克，M. H，和斯坎龙，M. J.(2015)。苔藓小立藤芽发育的细胞特异性转录组学分析。植物学报，83:743-751。
- 弗兰克，M. H，爱德华兹，M. B，舒尔茨，E. R，费，Z，索伦森，I.，罗斯，J. K，和斯坎隆，M. J.(2015)。分析了两个古老陆生植物谱系顶端细胞型芽分生组织的分子特征。新植物学家。207:893 - 904。
- 约翰斯顿，R，莱博夫，S.，和斯坎隆，M. J.(2014)。玉米叶鞘基部的个体发育。新植物学家。205:306 - 315。
- 庄士敦，王明明，孙启强，西尔维斯特，A. W.，哈克，S.，斯坎龙，M. J.(2014)。转录组学分析表明，玉米叶舌发育再现了侧器官启动过程中发生的基因表达模式。植物细胞。12月16日。pii: tpc.114.132688。[印刷前的Epub]。
- 弗兰克，M. H，和斯坎龙，M. J.(2014)。通过祖先配子体和孢子体遗传程序的协调选择，孢子体优势陆地植物芽分生组织功能进化的转录组学证据。分子生物学与进化。
- 张X，杜格尔，R. N，斯特雷贝尔，J.，李，M.，巴克纳，B.， Janick-Buckner, D.， Schnable, p.s.， Timmermans, m.c.，和斯坎隆，m.j.(2012)。点状维管表达1是玉米ta-siARF通路下游的一个新的叶片模式基因。植物生理学,159:1453 - 1462。
- Takacs, E.， Nettelton, D.， Schnable, P. S.， Muehlbauer, G. J.， Yu, J.， Timmermans, m.c.，和Scanlon, m.j .(2012)。玉米茎尖分生组织的个体发生。植物细胞24:3219-3234。
- 伍德沃德，J. B.，阿伯迪拉，N. D.，保罗，D.，菲利普斯，K.， Rapala-Kozik, M.， Freeling, M.， Begley, T. P.， Ealick, S. E.， McSteen, P.， & Scanlon, M. J.(2010)。一种玉米硫胺素营养不良菌在芽分生组织维持方面存在缺陷。植物细胞22:30 -3317。
- Ji, J.， Strable, J.， Shimizu, R.， Koenig, D.， Sinha, N.和Scanlon m.j .(2010)。WOX4促进原形成层发育。植物生理学,152:1346 - 1356。
外联和扩展重点
斯坎隆是一项新拨款的派，该拨款将培训杜鲁门州立大学(TSU)的本科生，这是密苏里州柯克斯维尔农村的一所公共文科院校，将对玉米发育突变体进行形态、表达和转录组学分析。Co-PI Timmermans的实验室将在第一年的夏天为一名TSU本科生提供8周的时间，对两个玉米发育突变体和非突变兄弟姐妹进行LM-RNAseq。Co-PI的Janick-Buckner和Buckner将花一周时间参观Timmermans的实验室，参与数据收集，并体验CSHL提供的许多丰富的机会。Co-PI Buckner将在第一年参加CSHL的基因组数据统计分析讲习班，以促进RNAseq数据的处理和分析，并指导TSU本科生这些技术。亚利桑那州立大学的本科生每年都将在玉米遗传学会议以及地方和区域会议上展示他们的数据。这些活动将使TSU Co-PI的学生和本科生接触到植物基因组学方面最先进的研究。Co-PI Owens(康奈尔大学)将指导REU夏季学生(1-3年级)，他们将研究在遮荫回避形态学方面表现极端的玉米系的光合生理。此外，欧文斯植物生理学实验课的本科生将参与利用体内叶绿素荧光监测筛选光合变异。
斯坎隆是美国国家科学基金会资助项目的PI，该项目为创建“从杂草到奇迹”提供了资金，这是一个多媒体公共教育计划，由冷泉港实验室多兰DNA学习中心(DDLC)的合作者大卫·米克罗斯博士领导。“从杂草到奇迹”将展示玉米研究的连续性——从本土农学家到农业育种家、玉米遗传学家、植物生理学家和分子生物学家——这在玉米基因组测序项目中达到了顶峰。在讲述人类对玉米植物进化的影响的同时，《从杂草到奇迹》也将讲述玉米对人类文化的影响。利用音频和视频格式的连续播客，“从杂草到奇迹”将提供科学、技术和社会之间相互作用的案例研究。多媒体内容将与DDLC开发的在线实验和生物信息学工具整合，并将与nsf资助的iPlant计划一起在全国传播。连续的实践实验将允许中学生、高中生和刚开始上大学的学生无缝地从核心性状的经典遗传分析，通过分子遗传和突变的生物信息学分析，到基因组结构和进化的检查。该项目已进入开发的第二年，预计将于2011年初发布。
一。目标。
斯坎隆实验室外联活动的目标有两个:(1)促进现代植物生物学的研究生和本科生教育和研究培训，(2)促进现代植物生物学的公共教育。
b.成就/外联活动
与杜鲁门州立大学合作:
在过去的7年里，PI Scanlon一直领导玉米SAM项目，这是美国国家科学基金会的一个植物基因组研究项目，它包含了一个本科生动手培训和教育项目，旨在传播对植物科学的理解和欣赏。在此期间，来自楚门州立大学(位于密苏里州柯克斯维尔农村的一所文科院校)的30多名不同的本科生在微阵列数据的注释、SAM数据库的创建和维护方面发挥了关键作用，并接受了对该项目中产生的玉米突变体进行遗传、组织学和分子分析的训练。杜鲁门大学的本科生参加了所有的项目会议，并每年在国际玉米遗传学会议上提交他们的数据。其中，12人获得了原创稿件，20余人从浙大毕业，正在攻读研究生学位。
研究及培训外展活动:
斯坎隆在佐治亚大学和康奈尔大学任职期间，训练了15名本科生进行分子遗传学的实验室工作。斯坎隆在佐治亚大学为研究生和本科生教授了六年的“基因技术”课程。两名生物学本科生在修完这门课程后，对获得分子生物学的研究经验产生了兴趣，并在斯坎隆的实验室工作。斯坎隆成为基因技术专业一名地理学博士生的联合导师，并训练他对一种濒危植物进行SSR分析。这名学生(现在是佛罗里达大西洋大学的助理教授)发表的两篇论文中所有的分子遗传学研究都是在乔治亚大学斯坎隆的实验室进行的。PI Scanlon作为NSF外展活动的一部分，在佐治亚州雅典的Cedar Shoals高中的AP生物学课堂上举办了研讨会;雪松浅滩高中约60%的学生代表科学领域代表性不足的少数群体。一名高中生被招募到斯坎隆实验室做兼职工作。2006年夏天，PI Scanlon的实验室接待了Gokhan Hacisalihoglu博士两周的时间，在那里他接受了qRT-PCR和激光微解剖微阵列技术的培训。Hacisalihoglu博士是佛罗里达农工大学的教授，这是一所位于佛罗里达州塔拉哈西的历史上的黑人大学。 Also during summer 2006 and 2007, Scanlon hosted and trained High School student Eric Kelsey, who was recruited from Kennebunkport, ME High School by Cornell’s PGRP REU outreach program. Kelsey worked on a project to analyze evolution of the narrow sheath duplicated genes in the genus Zea. Cornell undergraduate Devon Van Noble, an African-American student interested in public health and environmental law, worked as a laboratory assistant in the Scanlon laboratory for two years. During summer 2007, undergraduate student Doug Eudy (Truman State U) spent 10 weeks in the Scanlon lab studying reverse genetics and in summer 2008 undergraduate student Samantha Wronski (SUNY Canton) worked as an REU student learning reverse genetics and plant developmental biology. During summer 2009, NSF REU student Eric Schultz of Northern Illinois University worked with graduate student Margaret Frank on histological analyses of shoot branching in Selaginella and targeted mutagenesis of WOX genes in Physcomitrella. Currently, Cornell undergraduate biology students Molly Edwards and Neiman Tan are being trained for research work in the Scanlon laboratory. Scanlon currently serves as Co-PI on grant for the Cornell REU program funded by NSF.
公众教育外展活动-从杂草到奇迹:
另一个由Scanlon NSF-PGRP SAM拨款资助的扩展部分是由David Micklos博士领导的公共教育合作项目。David Micklos博士是位于冷泉港的多兰DNA学习中心(DDLC)的主任，这是一个非营利性的遗传学教育公共资源。Micklos开发了一个名为“从杂草到奇迹”的多媒体网站，展示了玉米研究的连续性——从本地农学家到农业育种家、玉米遗传学家、植物生理学家和分子生物学家——这在玉米基因组测序项目中达到了高潮。在讲述人类对玉米植物进化影响的同时，《杂草到奇迹》也讲述了玉米对人类文化的影响。利用音频和视频格式的连续播客，“从杂草到奇迹”提供了科学、技术和社会之间相互作用的案例研究。为了在2009年11月公布玉米基因组序列，DNALC的一个视频摄制组前往墨西哥，记录研究背后的故事，并将基因组序列放在玉米种植历史的背景下。这将在播客“玉米的爆炸起源”中呈现。此外，“玉米基因组测序”链接包括动画，详细描述了美国和墨西哥团队使用的不同dna测序方法，圣路易斯华盛顿大学基因组测序中心的视频参观，以及相关研究人员对该项目的评论。“从杂草到奇迹”的另一个作品是1909年CSHL的历史再现，乔治·沙尔解释了他关于杂交活力的实验，这是今天所有杂交玉米生长的基础。除了Shull的视频娱乐外，《杂交玉米的发展》还以Shull用杂交玉米做实验的动画、他的三篇原始研究论文和一个图片库为特色。芭芭拉·麦克林托克的《世界》讲述了这位诺贝尔奖得主的一生，其中包括这位科学家的照片以及她在CSHL实验室的人工制品，她在那里发现了转座子(所谓的“跳跃基因”)。 Two animations explain her work with transposons, and a downloadable PDF timeline of McClintock’s life and work is also available.
学生动手实验包括两个DNALC开发的在线实验笔记本。中学生版《孟德尔遗传》通过对人类和玉米遗传特性的探索，介绍了孟德尔定律。“检测玉米转座子”，针对年龄较大的学生，研究了玉米的一个青铜(bz)突变体，以分析基因型和表型之间的分子关系。
截至2010年3月31日，Weed to Wonder网站收到了51475次访问，这明显多于与CSHL研究人员合作开发的类似网站(Greenomes, 10461次访问，Dynamic Gene, 8971次访问)。在接下来的一年里，我们的合作者将根据在墨西哥拍摄的镜头编写更多关于玉米种植历史的故事，并预计将进行更多的视频旅行，以捕捉玉米作为一种主要作物和研究模型的发展故事的其他元素。
